БГ Н2 Общество е национален координатор в областта на водородните технологии и работи по утвърдената на 17 февруари 2004г. организационно-управленска структура.
Общо събрание
Върховен орган на СДРУЖЕНИЕТО е Общото събрание.
Правото на членство в ОС се определя както следва: всички членове на Сдружението са членове на Общото събрание; юридическите лица, обединени в Бизнес съвета, имат право на един член в ОС, който е Председателя на Бизнес съвета; физическите лица, обединени в Научния съвет, имат право на един член в ОС, който е председателя на Научния съвет.
Управителен съвет
Всеки член на УС отговаря за определена Постоянна тематична комисия и има право да бъде основен докладчик по въпроси от своята професионална сфера в Консултативно- координационния съвет (ККС) Дружеството.
- акад. дхн АЛЕКСАНДЪР КРУМОВ ПОПОВ, БАН
- проф. дхн АСЕН АНГЕЛОВ ГИРГИНОВ – ХТМУ, София
- проф. дтн ГЕОРГИ ПЕТРОВ ВИСОКОВ – МГУ, София
- проф. дхн МАРТИН СЛАВЧЕВ БОЖИНОВ – ХТМУ, София
- проф. дтн ЦВЕТИ БОГДАНОВ ЦВЕТКОВ, ХТМУ, София
Председател на Управителния съвет:
академик АЛЕКСАНДЪР КРУМОВ ПОПОВ, Заместник председател на БАН;
Изпълнителен директор:
проф. дтн ЦВЕТИ БОГДАНОВ ЦВЕТКОВ, Ръководител на Центъра по водородни технологии на ХТМУ.
Ръководители на направления:
- Директор „Енергетика“: проф. дхн Мартин Божинов – ХТМУ;
- Директор „Образование“: проф. дхн Тони Спасов – СУ;
- Директор „Околна среда“: проф. д-р Любен Тотев – МГУ;
- Директор „Отбрана и сигурност“: доц. д-р Митко Георгиев.
Консултативно-координационен съвет
ККС е помощен орган на обществени начала за консултации, координация и съвместни действия на БГ Н2 Общество с президентството, парламента, правителството, министерствата, ведомствата, БАН, университети и научни организации, с Европейската водородна асоциация, Европейския изследователски консорциум по водородни технологии и НАТО. Състав на съвета: Председателя на УС и Изпълнителния директор на БГ Н2 Общество, вицепрезидента на Република България, зам.-председател на Народното събрание, вицепремиер, министри и ръководителите на ХТМУ и БАН.

